Cette chapelle, qui faisait à l’origine partie de l’hôpital construit au XVIe siècle (aujourd’hui inexistant), est documentée depuis 1520. Elle trouve son origine dans une épidémie qui s’est déclarée dans les années 1400 et qui a causé une grande mortalité parmi les habitants de Maçanet. Les habitants, effrayés, promirent de construire un hôpital et une église dédiée à Saint Sébastien pour invoquer sa protection. L’hôpital est resté en service jusqu’au XVIIIe siècle et, plus tard, l’image du saint a été transférée dans l’église paroissiale. La chapelle a un plan rectangulaire, un clocher-mur et une porte et des fenêtres monolithiques rectangulaires. Après la construction de l’ensemble de la rue de Sant Sebastià, ce qui était l’hôpital a été utilisé à d’autres fins – presse municipale, crèche et habitacle – et aujourd’hui, après avoir été restauré, il est utilisé pour différentes activités.